Аналіз зв’язку поліморфізму rs1899663 гена довгої некодуючої РНК HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки

Анотація

Метою дослідження було вивчення можливої асоціації поліморфного сайту rs1899663 гена HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки та його клініко-патологічними характеристиками.

Методи. У роботі було використано венозна кров 101 пацієнта зі світлоклітинним нирково-клітинним раком (СКНКР) (42 жінки і 59 чоловіків). Генотипування за поліморфним локусом rs1899663 гена HOTAIR проводили за допомогою полімеразної ланцюгової реакції з наступним аналізом довжини рестрикційних фрагментів (PCR-RFLP). Статистичний аналіз виконували за допомогою пакету SPSS (версія 17.0). Тест Каплана-Мейера та регресія Кокса були використані для перевірки можливого зв’язку між поліморфізмом rs1899663 гена довгої некодуючої РНК HOTAIR та віком виникнення СКНКР. Значення Р < 0,05 вважали статистично значущими.

Результати. Результати генотипування за rs1899663-поліморфізмом гена HOTAIR показали, що у хворих із СКНКР співвідношення гомозигот GG, гетерозигот GT і гомозигот ТТ складає 39,6 %, 52,5 % і 7,9 %, відповідно. Цей розподіл не відхилявся від очікуваного за законом Харді-Вайнберга (P = 0,143). Результати однофакторного дисперсійного аналізу показали, що rs1899663-локус гена HOTAIR не асоційований із розмір пухлини хворих із СКНКР, не пов’язаний із показниками індексу маси тіла, швидкістю осідання еритроцитів, вмістом глюкози, гемоглобіну, креатиніну та лейкоцитів у крові пацієнтів із СКНКР (Р > 0,05). Крім цього результати тесту Каплана-Мейере показали, що тривалість життя до моменту виникнення СКНКР не залежить від rs1899663-локусу (log rank Р = 0,739). Разом із цим результати аналізу методом регресії Кокса без та з поправкою на коваріати (стать, індекс маси тіла, наявність метастазів, звички курити та зловживання алкоголем) продемонстрували, що ризик виникнення СКНКР з віком не залежить від поліморфізму rs1899663 гена HOTAIR (Р > 0,05).

Висновки. Виконане дослідження є першим щодо пошуку асоціації генетичного поліморфізму HOTAIR із виживаністю пацієнтів із раком нирки як в Україні, так і в усьому світі. Поліморфний сайт rs1899663 гена HOTAIR не асоційований із віком виникнення СКНКР в українській популяції. Крім цього, rs1899663-локус також не пов’язаний із розмірами пухлини та даними клініко-лабораторних досліджень у хворих із раком нирки.